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sra-tools

Toolkit NCBI para arquivos SRA

  • SRA bioinformatics toolkit
  • Linha de comando
  • BIOINFORMATICS
  • SEQUENCE ARCHIVE
  • Abre direto
  • Roda no terminal
codex · reviewed · 4 de jun. de 2026 descrição em pt-br · fallback

Descrição

Conjuntos de dados do Sequence Read Archive podem ser baixados, convertidos e processados com o NCBI SRA Toolkit compilado do código-fonte. O pacote instala muitos comandos, incluindo `prefetch` e `fasterq-dump`, além de bibliotecas e arquivos de configuração para acesso a arquivos INSDC. Ele pode baixar dados biológicos muito grandes e gravar árvores de saída extensas, então armazenamento, rede e credenciais de acesso controlado exigem planejamento.

Como rodar

fasterq-dump

Comandos: fasterq-dump

Permissões

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